对于许多蛋白质纯化，采用一系列不同的方法来获得纯蛋白质。蛋白质纯化策略描述了几种方法步骤的组合，并将其分为捕获、中间和抛光步骤。“捕获”步骤从粗提取物中纯化蛋白质。“中间”步骤去除进一步的污染，而最终“抛光”步骤的目的是去除所有残留的杂质，以获得高纯度的产品。根据进一步分析和/或使用蛋白质所需的蛋白质的产率和纯度，将几个步骤结合起来。在大多数情况下，蛋白质纯化的两个或三个步骤是结合在一起的。然而，只有一步或三步以上的纯化策略也是可能的。