离子交换柱可以基于二氧化硅或有机聚合物。
由于所用洗脱液的高pH值，可以在压制系统中使用二氧化硅基柱。基于二氧化硅的柱不能在pH = 7,5上方操作。
基于聚合物的离子交换柱能够承受更基本的条件。基于聚合物的分离塔是唯一用于压缩阴离子色谱的PTION。